而不是：

onclick="javascript:warningMessage('<%# Eval("ID") %>','<%# Eval("systempath").ToString().Replace("'",@"\'") %>','<%# Eval("root_level") %>','<%# Eval("Parentid") %>','<%# Eval(Container.DataItemIndex +1) %>');"

尝试使用类似：

onclick='<%# "javascript:warningMessage('" + Eval("ID").ToString() + "'" %>'