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遗传算法的基本概念和实现,附Java实现案例!

更新时间:2022-08-17 13:34:55

遗传算法的基本概念和实现,附Java实现案例!

如上图(左)所示,遗传算法的个体由多条染色体组成,每条染色体由多个基因组成。上图(右)展示了染色体分割和组合的方式。_


遗传算法的概念

自然选择的过程从选择群体中最适应环境的个体开始。后代继承了父母的特性,并且这些特性将添加到下一代中。如果父母具有更好的适应性,那么它们的后代将更易于存活。迭代地进行该自然选择的过程,最终,我们将得到由最适应环境的个体组成的一代。


这一概念可以被应用于搜索问题中。我们考虑一个问题的诸多解决方案,并从中搜寻出***方案。


遗传算法含以下五步:


初始化


个体评价(计算适应度函数)


选择运算


交叉运算


变异运算


初始化

该过程从种群的一组个体开始,且每一个体都是待解决问题的一个候选解。


个体以一组参数(变量)为特征,这些特征被称为基因,串联这些基因就可以组成染色体(问题的解)。


在遗传算法中,单个个体的基因组以字符串的方式呈现,通常我们可以使用二进制(1 和 0 的字符串)编码,即一个二进制串代表一条染色体串。因此可以说我们将基因串或候选解的特征编码在染色体中

遗传算法的基本概念和实现,附Java实现案例!

种群、染色体和基因


个体评价(计算适应度函数)

个体评价利用适应度函数评估了该个体对环境的适应度(与其它个体竞争的能力)。每一个体都有适应度评分,个体被选中进行繁殖的可能性取决于其适应度评分。适应度函数值越大,解的质量就越高。适应度函数是遗传算法进化的驱动力,也是进行自然选择的唯一标准,它的设计应结合求解问题本身的要求而定。


选择运算

选择运算的目的是选出适应性***的个体,并使它们将基因传到下一代中。基于其适应度评分,我们选择多对较优个体(父母)。适应度高的个体更易被选中繁殖,即将较优父母的基因传递到下一代。


交叉运算

交叉运算是遗传算法中最重要的阶段。对每一对配对的父母,基因都存在随机选中的交叉点。


举个例子,下图的交叉点为 3:

遗传算法的基本概念和实现,附Java实现案例!

父母间在交叉点之前交换基因,从而产生了后代。

遗传算法的基本概念和实现,附Java实现案例!

父母间交换基因,然后产生的新后代被添加到种群中。

遗传算法的基本概念和实现,附Java实现案例!

变异运算

在某些形成的新后代中,它们的某些基因可能受到低概率变异因子的作用。这意味着二进制位串中的某些位可能会翻转。

遗传算法的基本概念和实现,附Java实现案例!

变异运算前后


变异运算可用于保持种群内的多样性,并防止过早收敛。


终止

在群体收敛的情况下(群体内不产生与前一代差异较大的后代)该算法终止。也就是说遗传算法提供了一组问题的解。


#### 案例实现


种群的规模恒定。新一代形成时,适应度最差的个体凋亡,为后代留出空间。这些阶段的序列被不断重复,以产生优于先前的新一代。


这一迭代过程的伪代码:

START
Generate the initial population
Compute fitness
REPEAT
    Selection
    Crossover
    Mutation
    Compute fitness
UNTIL population has converged
STOP

Java 中的实例实现


以下展示的是遗传算法在 Java 中的示例实现,我们可以随意调试和修改这些代码。给定一组五个基因,每一个基因可以保存一个二进制值 0 或 1。这里的适应度是基因组中 1 的数量。如果基因组内共有五个 1,则该个体适应度达到最大值。


如果基因组内没有 1,那么个体的适应度达到最小值。该遗传算法希望最大化适应度,并提供适应度达到最大的个体所组成的群体。注意:本例中,在交叉运算与突变运算之后,适应度最低的个体被新的,适应度最高的后代所替代。

import java.util.Random;

/**
 *
 * @author Vijini
*/
//Main class
public class SimpleDemoGA {

    Population population = new Population();
    Individual fittest;
    Individual secondFittest;
    int generationCount = 0;

    public static void main(String[] args) {

        Random rn = new Random();

        SimpleDemoGA demo = new SimpleDemoGA();

        //Initialize population
        demo.population.initializePopulation(10);

        //Calculate fitness of each individual
        demo.population.calculateFitness();

        System.out.println("Generation: " + demo.generationCount + " Fittest: " + demo.population.fittest);

        //While population gets an individual with maximum fitness
        while (demo.population.fittest < 5) {
            ++demo.generationCount;

            //Do selection
            demo.selection();

            //Do crossover
            demo.crossover();

            //Do mutation under a random probability
            if (rn.nextInt()%7 < 5) {
                demo.mutation();
            }

            //Add fittest offspring to population
            demo.addFittestOffspring();

            //Calculate new fitness value
            demo.population.calculateFitness();

            System.out.println("Generation: " + demo.generationCount + " Fittest: " + demo.population.fittest);
        }

        System.out.println("\nSolution found in generation " + demo.generationCount);
        System.out.println("Fitness: "+demo.population.getFittest().fitness);
        System.out.print("Genes: ");
        for (int i = 0; i < 5; i++) {
            System.out.print(demo.population.getFittest().genes[i]);
        }

        System.out.println("");

    }

    //Selection
    void selection() {

        //Select the most fittest individual
        fittest = population.getFittest();

        //Select the second most fittest individual
        secondFittest = population.getSecondFittest();
    }

    //Crossover
    void crossover() {
        Random rn = new Random();

        //Select a random crossover point
        int crossOverPoint = rn.nextInt(population.individuals[0].geneLength);

        //Swap values among parents
        for (int i = 0; i < crossOverPoint; i++) {
            int temp = fittest.genes[i];
            fittest.genes[i] = secondFittest.genes[i];
            secondFittest.genes[i] = temp;

        }

    }

    //Mutation
    void mutation() {
        Random rn = new Random();

        //Select a random mutation point
        int mutationPoint = rn.nextInt(population.individuals[0].geneLength);

        //Flip values at the mutation point
        if (fittest.genes[mutationPoint] == 0) {
            fittest.genes[mutationPoint] = 1;
        } else {
            fittest.genes[mutationPoint] = 0;
        }

        mutationPoint = rn.nextInt(population.individuals[0].geneLength);

        if (secondFittest.genes[mutationPoint] == 0) {
            secondFittest.genes[mutationPoint] = 1;
        } else {
            secondFittest.genes[mutationPoint] = 0;
        }
    }

    //Get fittest offspring
    Individual getFittestOffspring() {
        if (fittest.fitness > secondFittest.fitness) {
            return fittest;
        }
        return secondFittest;
    }

    //Replace least fittest individual from most fittest offspring
    void addFittestOffspring() {

        //Update fitness values of offspring
        fittest.calcFitness();
        secondFittest.calcFitness();

        //Get index of least fit individual
        int leastFittestIndex = population.getLeastFittestIndex();

        //Replace least fittest individual from most fittest offspring
        population.individuals[leastFittestIndex] = getFittestOffspring();
    }

}

//Individual class
class Individual {

    int fitness = 0;
    int[] genes = new int[5];
    int geneLength = 5;

    public Individual() {
        Random rn = new Random();

        //Set genes randomly for each individual
        for (int i = 0; i < genes.length; i++) {
            genes[i] = rn.nextInt() % 2;
        }

        fitness = 0;
    }

    //Calculate fitness
    public void calcFitness() {

        fitness = 0;
        for (int i = 0; i < 5; i++) {
            if (genes[i] == 1) {
                ++fitness;
            }
        }
    }

}

//Population class
class Population {

    int popSize = 10;
    Individual[] individuals = new Individual[10];
    int fittest = 0;

    //Initialize population
    public void initializePopulation(int size) {
        for (int i = 0; i < individuals.length; i++) {
            individuals[i] = new Individual();
        }
    }

    //Get the fittest individual
    public Individual getFittest() {
        int maxFit = Integer.MIN_VALUE;
        for (int i = 0; i < individuals.length; i++) {
            if (maxFit <= individuals[i].fitness) {
                maxFit = i;
            }
        }
        fittest = individuals[maxFit].fitness;
        return individuals[maxFit];
    }

    //Get the second most fittest individual
    public Individual getSecondFittest() {
        int maxFit1 = 0;
        int maxFit2 = 0;
        for (int i = 0; i < individuals.length; i++) {
            if (individuals[i].fitness > individuals[maxFit1].fitness) {
                maxFit2 = maxFit1;
                maxFit1 = i;
            } else if (individuals[i].fitness > individuals[maxFit2].fitness) {
                maxFit2 = i;
            }
        }
        return individuals[maxFit2];
    }

    //Get index of least fittest individual
    public int getLeastFittestIndex() {
        int minFit = 0;
        for (int i = 0; i < individuals.length; i++) {
            if (minFit >= individuals[i].fitness) {
                minFit = i;
            }
        }
        return minFit;
    }

    //Calculate fitness of each individual
    public void calculateFitness() {

        for (int i = 0; i < individuals.length; i++) {
            individuals[i].calcFitness();
        }
        getFittest();
    }

}